Publikasjoner

NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.

2020

Sammendrag

I denne rapporten presenteres resultater fra biologisk veiledningsprøving av soppmidler i bygg, hvete, setteløk, gulrot og solbær. Det er også presentert et forsøk med skadedyrmidler mot kålmøll i kinakål. I tillegg er det rapportert et forsøk mot bringebærbarkgallmygg og ferskenbladlus, et forsøk med kairomonfeller mot skadedyr i eple, og et forsøk med vekstregulering av juletrær.

Sammendrag

Formålet med forprosjektet VitalEPLEJORD var å studere potensielle årsaker til jordtrøtthet i epleproduksjonen, et fenomen som kan oppstå dersom det ikke praktiseres vekstskifte. Jordprøver fra 10 bruk (fem med økologisk og fem med konvensjonell drift) på Øst- og Vestlandet ble undersøkt med tanke på jordkvalitet, nematoder og Phytophthora. Innen hver av de tre kategoriene ble det gjort interessante funn. Både lite fruktbar jord og skadegjørere kan føre til dårlig etablering, svak tilvekst, avlingsreduksjon og at trær i verste fall dør. I de jordkjemiske analysene ble det vist høyere innhold av organisk materiale, totalt nitrogen og plantetilgjengelig fosfor i økologisk enn konvensjonell drift, samt mer stabilt innhold av plantetilgjengelig magnesium, mer stabil pH og mer stabil basemetningsgrad. Det ble identifisert en rekke nematodearter, inkludert flere planteparasittære. Økologisk drift så ut til å kunne øke bakteriekonsumerende nematoder, minske rotkonsumerende nematoder og øke altetere. Innen Phytophthora ble det funnet fire arter der alle er rapportert som alvorlige skadegjørere på treaktige vekster både i Norge og andre land. Phytophthora forekom ved begge driftsformer. Antallet jordprøver var totalt 50 (5 samleprøver/bruk, hver samleprøve kom fra separate rader). Testomfanget var for lite til å dra konklusjoner om årsak til jordtrøtthet, men det har gitt verdifull kunnskap til å bygge videre på.

Sammendrag

Skogens helsetilstand påvirkes i stor grad av klima og værforhold, enten direkte ved tørke, frost og vind, eller indirekte ved at klimaet påvirker omfanget av soppsykdommer og insektangrep. Klimaendringene og den forventede økningen i klimarelaterte skogskader gir store utfordringer for forvaltningen av framtidas skogressurser. Det samme gjør invaderende skadegjørere, både allerede etablerte arter og nye som kan komme til Norge i nær framtid. I denne rapporten presenteres resultater fra skogskadeovervåkingen i Norge i 2019 og trender over tid.....

Sammendrag

Endogenous antimicrobial peptides (AMPs) are evolutionarily ancient factors of innate immunity, which are produced by all multicellular organisms and play a key role in their protection against infection. Red king crab (Paralithodes camtschaticus), also called Kamchatka crab, is widely distributed and the best known species of all king crabs belonging to the family Lithodidae. Despite their economic importance, the genetic resources of king crabs are scarcely known and no fullgenome sequences are available to date. Therefore, analysis of the red king crab transcriptome and identifcation and characterization of its AMPs could potentially contribute to the development of novel antimicrobial drug candidates when antibiotic resistance has become a global health threat. In this study, we sequenced the P. camtschaticus transcriptomes from carapace, tail fap and leg tissues using an Illumina NGS platform. Libraries were systematically analyzed for gene expression profles along with AMP prediction. By an in silico approach using public databases we defned 49 cDNAs encoding for AMP candidates belonging to diverse families and functional classes, including buforins, crustins, paralithocins, and ALFs (anti-lipopolysaccharide factors). We analyzed expression patterns of 27 AMP genes. The highest expression was found for Paralithocin 1 and Crustin 3, with more than 8,000 reads. Other paralithocins, ALFs, crustins and ubiquicidins were among medium expressed genes. This transcriptome data set and AMPs provide a solid baseline for further functional analysis in P. camtschaticus. Results from the current study contribute also to the future application of red king crab as a bio-resource in addition to its being a known seafood delicacy.

Til dokument

Sammendrag

European ash (Fraxinus excelsior) is threatened by the invasive ascomycete Hymenoscyphus fraxineus originating from Asia. Ash leaf tissues serve as a route for shoot infection but also as a sporulation substrate for this pathogen. Knowledge of the leaf niche partitioning by indigenous fungi and H. fraxineus is needed to understand the fungal community receptiveness to the invasion. We subjected DNA extracted from unwashed and washed leaflets of healthy and diseased European ash to PacBio sequencing of the fungal ITS1-5.8S-ITS2 rDNA region. Leaflets from co-inhabiting rowan trees (Sorbus aucuparia) served as a reference. The overlap in leaflet mycobiomes between ash and rowan was remarkably high, but unlike in rowan, in ash leaflets the sequence read proportion, and the qPCR-based DNA amount estimates of H. fraxineus increased vigorously towards autumn, concomitant with a significant decline in overall fungal richness. The niche of ash and rowan leaves was dominated by epiphytic propagules (Vishniacozyma yeasts, the dimorphic fungus Aureobasidion pullulans and the dematiaceous hyphomycete Cladosporium ramotenellum and H. fraxineus), and endophytic thalli of biotrophs (Phyllactinia and Taphrina species), the indigenous necrotroph Venturia fraxini and H. fraxineus. Mycobiome comparison between healthy and symptomatic European ash leaflets revealed no significant differences in relative abundance of H. fraxineus, but A. pullulans was more prevalent in symptomatic trees. The impacts of host specificity, spatiotemporal niche partitioning, species carbon utilization profiles and life cycle traits are discussed to understand the ecological success of H. fraxineus in Europe. Further, the inherent limitations of different experimental approaches in the profiling of foliicolous fungi are addressed.

Til dokument

Sammendrag

Shallot (Allium cepa var. aggregatum), a small bulb onion, is widely grown in the world. We previously reported a droplet-vitrification for cryopreservation of in vitro-grown shoot tips of shallot genotype ‘10603’. The present study further evaluated rooting, vegetative growth, bulb production and contents of biochemical compounds, as well as genetic stability in cryo-derived plants. The results showed no significant differences in rooting, vegetative growth, bulb production and contents of soluble sugars and flavonols between the cryo- and in vitro-derived plants. Analyses of ISSR and AFLP markers did not detect any polymorphic bands in the cryo-derived plants. These results indicate rooting and vegetative growth ability, biochemical compounds and genetic stability were maintained in cryo-derived plants. The present study provides experimental evidences that support the use of cryopreservation method for long-term preservation of genetic resources of shallots and other Allium species.