Publikasjoner
NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.
2024
Forfattere
Mari Talgø Syvertsen Payel Bhattacharjee Igor A. Yakovlev Torstein Tengs Kaia Slågedal Mallikarjuna Rao Kovi Marcos Viejo Carl Gunnar Fossdal Jorunn Elisabeth OlsenSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Sharkavirus (Plum pox virus, PPV) er en karanteneskadegjører som har blitt funnet i plomme, fersken og aprikos i Norge. Første påvisning var i 1998. Fra 1998 til 2013 ble det utført kartleggings- og utryddingsprogram flere av årene med det mål å utrydde sharkavirus fra frukthager med kommersiell plommedyrking i Norge. Kartleggingen i 2023 ble planlagt for å oppdatere og dokumentere smittestatus i Norge, samt få grunnlag for framtidig regulering/kategorisering av sharkavirus i revidert plantehelseforskrift. Programmet hadde som ønske å sjekke status for sharkavirus i Norge 10 år etter forrige kartlegging i 2013. Det ble testet 2463 prøver for sharkavirus i 2023. Alle disse prøvene var bladprøver. I alt 139 lokaliteter i 11 fylker ble kartlagt. På i 33 av disse lokalitetene ble det funn av sharkavirus. Litt under halvparten av disse, 15 steder var nye funnsteder. Vestland fylke hadde flest kartlagte lokaliteter (65), hvorav 19 hadde funn av sharkavirus, inkludert 10 nye funnsteder. Plommesortene med flest påvisninger var Mallard, Jubileum og Valor. Siden 1998 har det blitt testet mer enn 90 000 trær på i overkant av tusen lokaliteter (frukthager, privathager, planteskoler og hagesentre). Det har blitt påvist sharkavirus på 111 lokaliteter når vi regner inn 2023-funnene.
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Erwinia amylovora, the causative agent of fire blight of pome fruits and other rosaceous plants belongs to the group of regulated quarantine pests. The aim of this work was to characterize the populations of E. amylovora in Norway and their geographical distribution. A total of 238 E. amylovora isolates recovered from symptomatic host plants in Norway between 1986 and 2004 were genotyped by means of a short sequence repeat (SSR) marker (ATTACAGA) on plasmid pEa29. The SSR region was amplified and amplicon size determined using fluorescent labelling and rapid, automated capillary gel electrophoresis. All isolates contained the pEa29 plasmid harbouring the investigated marker. In total, ten genotypes were identified, of which two were detected only once. The number of repeats varied from 3 to 13, with 43% of the isolates containing five repeats. Of 17 isolates collected between 1986 and 1991, all but one contained five repeats, whereas more variation was observed in isolates from the period 2000 to 2004. Most of the isolates (80%) originated from Cotoneaster bullatus, hence no relationship between genotype of the isolate and host species that it was isolated from could be detected. This historic data suggests multiple introductions of E. amylovora to Norway.
Sammendrag
I denne rapporten presenteres resultater fra validering av VIPS-Ugras i vårkorn og biologisk veiledningsprøving av ugrasmidler mot ugras i potet på friland, til nedvisning av potetris, mot ugras i gulrot og rotpersille (ulike strategier), og mot ugras i kålrot og rødbete (enkle screeningforsøk).
Forfattere
Mirella Ludwiczewska Paulina Paluchowska Marta Janiszewska Erik Lysøe Simeon Rossmann Sylwester Sobkowiak Zhimin Yin May Bente Brurberg Jadwiga ŚliwkaSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Paulina Paluchowska Zhimin Yin Erik Lysøe Simeon Rossmann Mirella Ludwiczewska Marta Janiszewska May Bente Brurberg Jadwiga ŚliwkaSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Paulina Paluchowska Simeon Rossmann Erik Lysøe Marta Janiszewska Krystyna Michalak Rasoul Heydarnajad Giglou Mousa Torabi Giglou May Bente Brurberg Jadwiga Śliwka Zhimin YinSammendrag
Background Potato virus Y (PVY) is among the economically most damaging viral pathogen in production of potato (Solanum tuberosum) worldwide. The gene Rysto derived from the wild potato relative Solanum stoloniferum confers extreme resistance to PVY. Results The presence and diversity of Rysto were investigated in wild relatives of potato (298 genotypes representing 29 accessions of 26 tuber-bearing Solanum species) using PacBio amplicon sequencing. A total of 55 unique Rysto-like sequences were identified in 72 genotypes representing 12 accessions of 10 Solanum species and six resistant controls (potato cultivars Alicja, Bzura, Hinga, Nimfy, White Lady and breeding line PW363). The 55 Rysto-like sequences showed 89.87 to 99.98% nucleotide identity to the Rysto reference gene, and these encoded in total 45 unique protein sequences. While Rysto-like26 identified in Alicja, Bzura, White Lady and Rysto-like16 in PW363 encode a protein identical to the Rysto reference, the remaining 44 predicted Rysto-like proteins were 65.93 to 99.92% identical to the reference. Higher levels of diversity of the Rysto-like sequences were found in the wild relatives of potato than in the resistant control cultivars. The TIR and NB-ARC domains were the most conserved within the Rysto-like proteins, while the LRR and C-JID domains were more variable. Several Solanum species, including S. antipoviczii and S. hougasii, showed resistance to PVY. This study demonstrated Hyoscyamus niger, a Solanaceae species distantly related to Solanum, as a host of PVY. Conclusions The new Rysto-like variants and the identified PVY resistant potato genotypes are potential resistance sources against PVY in potato breeding. Identification of H. niger as a host for PVY is important for cultivation of this plant, studies on the PVY management, its ecology, and migrations. The amplicon sequencing based on PacBio SMRT and the following data analysis pipeline described in our work may be applied to obtain the nucleotide sequences and analyze any full-length genes from any, even polyploid, organisms. Keywords Amplicon sequencing, AmpSeq, Extreme resistance, Hyoscyamus niger, PacBio, Physalis peruviana, PVY, Solanum
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag