Publikasjoner
NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.
2011
Forfattere
Alain Ratnadass P Ryckewaert Zarathou Claude Albert Nikiema D Pasternak L. Woltering Karl Thunes O Zakari-MoussaSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
In spring and autumn 2011, we carried out a baiting program for Phytophthora spp. in urban streams and lakes in Rogaland and Hordaland counties in western Norway, and in a stream in a beech forest in Vestfold county in southeastern Norway. We used rhododendron leaves from the cultivar ‘Cunningham White’ as bait. Prior to baiting, all leaves were surface sterilized with 70% ethanol and placed in perforated bags (2-3 leaves per bag), each with a styrofoam floater to keep the bait near the surface. The bags were anchored to the shore and left in the water for 6-8 days. All locations were recorded with a field mapping GPS-device, and thus all mapping tasks could be finalized in the field. At many locations the leaves had dark and/or water soaked spots when removed from the water. Small sections from the leading edges were dissected and plated on Phytophthora-selective media (PARP and/or PARPH). One interesting finding was P. ramorum in a river in Rogaland county, but we also isolated a number of other Phytophthora spp. that are currently being identified. The results will be presented at the meeting.
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Nematodes, commonly known as round worms, are the most common multicellular animals on planet Earth. After 1000 million years of evolution members of the phylum Nematoda have a high bionomic diversity. As habitants of the soil and rhizosphere nematodes are involved en energy fluxes, and affect carbon and nutrient cycles. As plant parasites, either alone or in synergism with other pathogens, nematodes are responsible for plant disease complexes and major crop losses. A growth depression in a field of potato (Solanum tuberosum) cv. Saturna [resistant to pathotype Ro1 of potato cyst nematode (PCN) Globodera rostochiensis], suggestive of potato cyst nematode damage, was detected in Grue, eastern Norway. Analyses of soil samples did not detect PCN, but demonstrated the occurrence of a large number of lesion nematodes Pratylenchus penetrans .Tubers from the depressed part of the field had severe symptoms similar to those caused by the common scab bacterium Streptomyces scabies. Potato yield was reduced by 50% in the affected area of the field. Transect-sampling showed plant growth to be negatively correlated with densities of P. penetrans and suggested a damage threshold of potato to the nematode of 100 specimens per250 g of soil. Common scab (Streptomyces scabies) occurred frequently in the affected area. P. penetrans was present in roots, underground stems, stolons and tubers. Tubers from the depressed part of the field had severe symptoms similar to those caused by the common scab bacterium. In tubers, nematodes were detected inside cross-lesions typical symptoms of common scab, and occurred also in the outermost 0.5 mm tissue associated with such lesions. In pots with sterile sand, micro-tubers of potato cv. Saturna, produced from meristems, were grown in a green-house infected with, P. penetrans, S. scabies, and a combination of P. penetrans and, S. scabies. P. penetrans alone induced tuber lesions similar to those of common scab. Also, the combined inoculation of the bacterium and the nematode seemed to enhance symptom expression. Similar scab symptoms, in connection with lesion nematode infections, have been observed on potato tubers cv. Oleva, which also is relatively tolerant to common scab. Symptomatic tubers cv. Saturna first stored at 4o C for 20 weeks were transferred to pots with sterile sand and grown for 3 months in the green-house. In these cultures P. penetrans was first detected in soil 8 weeks after planting. Examination at harvest of soil, roots, stolons, tubers demonstrated symptoms typical of P. penetrans. Interestingly, P. penetrans survives storage of potatoes, from which new infections may develop. Hence, potato tubers do appear to be an important means for the spread of P. penetrans to new areas. The fact that the symptoms induced by this nematode may be mistaken for symptoms of common scab suggests that the frequency of S. scabies might have been overestimated in regular surveys. Infections by P. penetrans have important implications for scab control. This pertains in particular to recommended maintenance of high soil moisture at and during 4-9 weeks after tuber set. If symptoms are related to nematode infection rather than to the scab bacterium, this recommendation would allow for a rapid build-up of lesion nematodes resulting in a decrease in both yield and marketability of the tubers. Further studies are needed to investigate the extent of this problem.
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Nematoder (rundormer) er mest kjent som parasitter i dyr, mennesker og planter. Størstedelen av nematodene (ca. 60 %) lever imidlertid fritt i jord og vann og er ikke parasitter. De er ørsmå, gråhvite, «markliknende» organismer som er viktige for omdanning av organisk materiale og sirkulering av næringsstoffer i jorda. De fleste jordlevende arter er < 1 mm og lever i vannfilmen rundt jordpartikler og røtter.
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Fusarium langsethiae er et stort problem i nordisk kornproduksjon. Den forekommer i hovedsak på havre, men finnes også på bygg og i svært liten grad i hvete. Når kornet blir angrepet av Fusarium- sopper kan man vanligvis se skadene fra soppen og dermed vurdere hvor stort angrepet er. Dette er ikke tilfelle for F. langsethiae, som opptrer uten symptomer på havre. Dette kan gi en falsk trygghet, fordi akkurat denne arten produserer de mest giftige av Fusarium trichothecenene, T-2 og HT-2 toksin. For å forstå mer om F. langsethiae har vi studert genuttrykket av soppen under tre forskjellige betingelser, 1) på havrekorn, 2) på blomstrende havreaks og 3) på et næringsrikt vekstmedium. Den tredje prøven ble brukt som sammenligningsgrunnlag. Fra disse tre eksperimentene har vi sekvensert de aktive soppgenene. Vi har benyttet en ny metode (454 pyrosekvensering) som gir ufattelige mengder data, i dette tilfellet 1,3 millioner sekvenser. Man bruker deretter bioinformatiske verktøy for å finne ut hvilke biologiske mekanismer som fungerer under de forskjellige betingelsene. Vi vil presentere noen resultater fra dette studiet. F. langsethiae er foreslått å være i slektskap med F. sporotrichioides, som produserer de samme toksinene, HT-2 og T-2. Denne vurderingen er gjort på bakgrunn av sekvensering av enkelte gener, sammenligning av metabolske profiler, morfologisk karakter mm. Resultater fra vår studie, som er basert på store menger sekvensdata, viser at F. langsethiae har mer likhet med en annen viktig sopp, F. graminearum. Denne Fusarium-arten produserer toksinet deoxynivalenol (DON), og er vanlig å finne i norsk korn. Dette viser at selv om to arter produserer samme toksiner, trenger de ikke være i nært slektskap. En annen egenskap som er funnet hos F. langsethiae, er sannsynlig produksjon av en ny forbindelse som til nå ikke er kjent i norsk korn. Ingen andre Fusarium arter er kjent for å produsere denne metabolitten. På korn-mediet er alle genene som behøves for syntesen av dette stoffet, høyt uttrykt. Neste skritt er å se om vi finner stoffet i kornprøver. Giftigheten til dette stoffet er fremdeles ukjent, men det kan vise seg å utgjøre et nytt problem hvis det er vanlig forekommende i havre. Dette viser at med bioinformatiske metoder kan man avdekke nye egenskaper som i utgangspunktet er skjulte hos soppene.