Publikasjoner
NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.
2006
Forfattere
Hege Hvattum Divon Carmit Ziv Olga Davydov Oded Yarden Robert Fluhr Hege DivonSammendrag
Fusarium oxysporum is a soil-borne pathogen that infects plants through the roots and uses the vascular system for host ingress. Specialized for this route of infection, F. oxysporum is able to adapt to the scarce nutrient environment in the xylem vessels. Here we report the cloning of the F. oxysporum global nitrogen regulator, Fnr1, and show that it is one of the determinants for fungal fitness during in planta growth. The Fnr1 gene has a single conserved GATA-type zinc finger domain and is 96% and 48% identical to AREA-GF from Gibberella fujikuroi, and NIT2 from Neurospora crassa, respectively. Fnr1 cDNA, expressed under a constitutive promoter, was able to complement functionally an N. crassa nit-2(RIP) mutant, restoring the ability of the mutant to utilize nitrate. Fnr1 disruption mutants showed high tolerance to chlorate and reduced ability to utilize several secondary nitrogen sources such as amino acids, hypoxanthine and uric acid, whereas growth on favourable nitrogen sources was not affected. Fnr1 disruption also abolished in vitro expression of nutrition genes, normally induced during the early phase of infection. In an infection assay on tomato seedlings, infection rate of disruption mutants was significantly delayed in comparison with the parental strain. Our results indicate that FNR1 mediates adaptation to nitrogen-poor conditions in planta through the regulation of secondary nitrogen acquisition, and as such acts as a determinant for fungal fitness during infection.
Forfattere
Anne S. Halstensen Karl-Christian Nordby Sonja Klemsdal Oleif Elen Per Erik Clasen Weijnand EduardSammendrag
Trichothecenes are immunosuppressive mycotoxins produced mainly by Fusarium spp. and often are detected as natural contaminants of grain and other agricultural products. Exposure to trichothecenes through inhalation during grain work may represent possible health risks for grain farmers. We aimed, therefore, to investigate the level of Fusarium spp. and trichothecenes in settled grain dust collected during work on 92 Norwegian farms. Mycotoxins were determined by gas chromatography-mass spectrometry, whereas the Fusarium spp. were identified and quantified both by species-specific semiquantitative polymerase chain reaction (PCR) and by cultivation. All potential trichothecene-producing molds in the grain dust were quantified using a PCR assay specific for tri5, the gene coding for trichodiene synthase that catalyzes the first step in the trichothecene biosynthesis. We performed correlation analysis between mold-DNA and mycotoxins to assess whether the PCR-detected DNA could be used as indicators of the mycotoxins. The methodological problem of detecting small amounts of airborne mycotoxins during grain work may then be avoided. Whereas the trichothecene-producing Fusarium species in grain dust could not be identified or quantified to a sufficient extent by cultivation, all investigated Fusarium spp. could be specifically detected by PCR and quantified from the DNA agarose gel band intensities. Furthermore, we observed a strong correlation between the trichothecenes HT-2 toxin (HT-2) or T-2 toxin (T-2) and DNA specific for tri5 (r = 0.68 for HT-2 and r = 0.50 for T-2; p < 0.001), F. langsethiae (r = 0.77 for HT-2 and r = 0.59 for T-2; p < 0.001), or F. poae (r = 0.41 for HT-2 and r = 0.35 for T-2; p < 0.001). However, only a moderate correlation was observed between the trichothecene deoxynivalenol ( DON) and the combination of its producers, F. culmorum and F. graminearum (r = 0.24, p = 0.02), and no significant correlation was observed between DON and tri5. PCR clearly improved the detection of toxigenic Fusaria as potential sources of health risks for farmers inhaling grain dust during work, but the use of Fusarium-DNA as indicators for trichothecenes should be used cautiously.
Forfattere
Erik LysøeSammendrag
Flere av de soppartene som naturlig finnes i korn, kan produsere giftstoffer. Det er et mål å redusere mengden av slike sopptoksiner til et nivå som gjør at vi trygt kan benytte kornet som råstoff for produksjon av mat eller dyrefòr. Den viktigste kilden til mykotoksiner ute på kornåkeren er Fusarium. Ulike Fusarium-arter kan produsere flere forskjellige mykotoksiner. Kunnskap om hvordan denne produksjonen skjer kan bidra til å redusere dette problemet.Ved å studere prosesser i Fusarium-sopper som produserer store mengder av soppgiften zearalenon, har de klart å frambringe viktig kunnskap om hvordan denne soppgiften dannes i soppen. Zearalanon er en østrogenlignende forbindelse som virker som en hormonhermer i mennesker og dyr, og er et av de vanligste mykotoksinene man finner i korn. Flere soppgener som var mye mer aktive når zearalenon ble produsert enn når denne forbindelsen ikke ble laget, ble funnet og karakterisert. Det ble laget en Fusarium-mutant der ett av soppgenene, PKS4, var inaktivert. Denne mutanten hadde mistet sin evne til å produsere zearalenon. På denne måten kunne man sikkert identifisere ett av flere gener som var absolutt nødvendig for at Fusarium skulle kunne lage dette toksinet. Genet PKS4 kodet for en polyketidsyntase, og hvordan aktiviteten av dette og andre gener ble regulert når zearalenon ble laget, ble studert i mer detalj. Aktiviteten av de samme genene ble også studert i unge hvete- og havrekorn som var smittet med Fusarium. Zearalenon sin rolle i soppen var tidligere ukjent, men basert på resultater framkommet i dette arbeidet er man ett skritt nærmere en forståelse av denne prosessen.
Sammendrag
Grøne blad og vakre, raude bær midt på vinteren har gjort kristtorn til eit populært innslag i julepyntinga. For at dette skal kunna halda fram, må det setjast i verk tiltak mot det omfattande bladfallet ein ser i klyppegrøntfelt og viltveksande kristtorn. Bladfallet ser hovudsakeleg ut til å skuldast aukande angrep av soppsjukdomar. Det kan vera fleire årsaker til meir soppsjukdomar, men i viltveksande kristtorn har det truleg samanheng med auka gjengroing pga. mindre beiting og lite stell av plantene. Spørsmålet er difor om stell og beiting med sau kan bøta på dette.
Forfattere
Ingvild Wartiainen Bjørn Frantzen Alexei Bambulyak Pål B. Mortensen Espen Hansen Sergey Zhavoronkin Ole Anders Lindseth Bjørn Kristoffersen Dag Nagoda Vladimir Bakharev Ole Kristian Bjerkemo Tom Gederø Mikhail Kalentchenko Terje Alling Vladislav Pesko Alf E. Jakobsen Harald Larsen Aksel JensenSammendrag
Gjennom artikler skrevet av forskere, myndigheter, miljøorganisasjoner og politikere på norsk og russisk side presenteres nærings- og biologiske interesser i Barentshavet. Det gis også et innblikk i hvilke forventninger og bekymringer lokalsamfunn i området har til petroleumsaktiviteten og annen næringsaktivitet i havet.
Forfattere
Steinar Wikan Paul Eric Aspholm Paul Eric AspholmSammendrag
Bisam, Ondatra zibethicus, er en innvandret art i Sør-Varanger. Dagens bestand etablerte seg i området rundt midten av 1980 tallet. I likhet med mange nyinnvandrede arter viste bisambestanden en sterk vekst ved etableringen, men denne avtok etter ca 10 år. Bestanden av bisam økte kraftig i Pasvik naturreservat i 2006, og er nå på det høyeste siden krakket i bestanden i 1998. Basert på registreringer av hus ble bestanden beregnet til å være 155 individer i Pasvik naturreservat.
Sammendrag
The strategy to mitigate phosphorus (P) losses in areas of arable cropping in Norway has focused on measures to reduce erosion. Risk assessment of erosion has formed the basis for implementation of measures. The soil P content has increased during the last decades motivating an evaluation of its effect on P transfer in the landscape. The present study describes the spatial variability of runoff P concentrations from an agricultural dominated catchment (4.5 km2) representative for agriculture in south-eastern Norway. The concentrations of suspended sediments (SS), total P (TP) and dissolved reactive P (DRP) in runoff from 22 subcatchments (0.3 "263 ha) during one year (monthly and during runoff-events) were evaluated. Contributions from point sources were 38 kg TP yr-1 compared to a total P loss of 685 kg yr-1 from the whole catchment. During low flow, mean diffuse TP concentration in runoff from subcatchments varied from 28 to 382 µg L-1. The mean low flow TP concentration was 39 µg L-1 from the housing area (only diffuse runoff) and 33 µg L-1 from the forested area. During high flow the highest diffuse TP concentration was measured in an area with high erosion risk and high soil P status. At the subcatchment level the transfer of SS varied from 25 to 175% of the whole catchment SS transfer. Correspondingly for TP, the transfer varied from 50 to 260% of the whole catchment TP transfer. For each of five agricultural subcatchments the slope of the relationship between TP and SS concentrations reflected the mean soil P status of the subcatchment. Erosion risk estimates were closely related to the SS concentration (R2 = 0.83). The study illustrates that soil P status in addition to soil erosion are important factors for P transfer.
Sammendrag
The ability of perennial grasses to maintain frost hardiness throughout the winter, and to resist dehardening during periods of mild weather is crucial for winter survival in the northern region. We tested the effects of dehardening conditions on two contrasting varieties of timothy and two of perennial ryegrass. The plants were grown in pots placed close together in the field to simulate sward conditions. Dehardening treatments started in January and April when bags with plants were brought from the field into a phytotron and treated with 3o, 9o and 15oC, 12 h light. The degree of dehardening was measured as loss of frost tolerance (LT50) after the plants were exposed to the dehardening conditions for 0, 2, and 6 and 9 days. Perennial ryegrass was less frost hardy than timothy, and in April the ryegrass plants were in bad shape and had lost almost all hardiness. The `Engmo" timothy had an initial higher degree of frost hardiness than `Grindstad" timothy both in January and April. However, `Engmo lost frost hardiness at the same rate or quicker than `Grindstad" when exposed to 9o and 15oC both in January and April. It however maintained almost all hardiness at 3oC, whereas Grindstad also at this temperature dehardened substantially. The study did not confirm the hypothesis that the more winter hardy cultivars deharden more slowly than the less frost tolerant cultivars. However, further studies need to be conducted to investigate in more detail whether there is a differing cardinal temperature for dehardening between cultivars.
Sammendrag
Hagtornrust har tvunge vertskifte mellom einer og hagtorn. Våren 2006, var det svært mykje hagtornrust på einer i Ås-området. Barken på stamme og greiner var delvis dekka av oransje, geleaktige utvekstar/"horn". Soppen overvintrar berre på einer, der det vert danna fleirårig mycel (nettverk av sopptrådar). Dei oransje "horna" vert danna når overvintringsstadiet (teleutostadiet) svulmar opp. Teleutosporar spirer og gir opphav til nye sporar (basidiesporar) som spreiar seg med vind til hagtorn. Basidiesporane spirer på nyveksten av hagtorn og fører til at blad, bladstilkar, årsskot, blomar og frukter svell opp.
Sammendrag
På ettersommaren 2006, vart det funne to nye soppsjukdomar i norske grøntanlegg. Den eine sjukdomen var mjøldogg (Microsphaera syringae syn. Erysiphe syringae) på syrin ved fleire lokalitetar i Oslo, Akershus, Buskerud og Telemark. Den andre var Guignardia aesculi ("leaf blotch" på engelsk) på blad av hestekastanje i Horten, Tønsberg og Sandefjord. Byrjande angrep vart også registrert i planteskulen ved UMB på Ås.