Publikasjoner
NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.
2004
Sammendrag
Gamle, tradisjonelle driftsformer skapte artsrike beite- og slåttemarker. Omleggingen av jordbruket har imidlertid ført til fragmentering og reduksjon av mange av disse habitatene i kulturlandskapet, og dermed lokal utrydding av plantearter og genetiske ressurser. Målet med studien var å prøve ut en dokumentasjonsmetode for videre utvikling av forvaltningsstrategier som ivaretar fôrplanter, bærekraftige økosystemer og artsmangfoldet. Kattefot (Antennaria dioica) ble valgt som representativ studieart for kulturmarksarter som man fortsatt anser som vanlige i Trøndelag. Kattefot er særbu, med kjønnet og vegetativ formering. Herbariebelegg og krysslister fra herbariet, Vitenskapsmuseet, NTNU ble gjennomgått og elleve gamle lokaliteter for kattefot ble besøkt på nytt i 2002. Arten ble gjenfunnet på ni av lokalitetene, men antall blomstrende individer varierte sterkt fra lokalitete til lokalitet. På tre av dem ble det funnet kun hunnplanter, mens en lokalitet hadde kun hanplanter. Alle de besøkte lokalitetene var omkranset av arealer med både intensivt åkerbruk og gjengroende kulturmarker. Kattefotpopulasjonene lå derfor isolert til i forhold til andre gjenværende habitater. Lokalt kan kattefotpopulasjonene bestå ved hjelp av vegetativ formering. Situasjonen for kattefot i Trøndelag på noe lengre sikt ser likevel ut til å være alvorlig siden frørekrutteringen mange steder trolig hindres på grunn av isoleringen. Dette er trolig også situasjonen for mange andre "vanlige" kulturmarksarter, dvs. arter knyttet til de samme habitatene som kattefot. Det er derfor viktig å utvikle forvaltningsstrategier som sikrer levedyktige populasjoner av disse artene, ved å sikre et tilstrekkelig antall habitater som ikke blir liggende for langt fra hverandre.
Sammendrag
The quantitative expression and the regulation of chitinase-encoding genes ech30, ech42 and nag1 in Trichoderma atroviride P1 under varying growth conditions were investigated using real-time RT-PCR, principle component and multivariate analyses. Twelve media combinations including 0.1 % and 3 % glucose as carbon source and no (0 mM), low (10mM) and high (100 mM) ammonium acetate as nitrogen source combined with or without colloidal chitin at 3 time intervals and 2 replications were applied to current study. The real-time RT-PCR analysis showed that the expression of ech30, ech42 and nag1 was regulated by the interaction of nitrogen, glucose and chitin under different growth conditions. The highest and earliest expressions of ech30 were induced by glucose and nitrogen starvation i.e. 0.1% glucose and 10 mM ammonium acetate in the growth media. This was also the case for ech42 and nag1 but at a relatively low level. In contrast, high (3%) glucose and high (100 mM) ammonium acetate concentrations repressed the expression of all the genes studied. These results were confirmed by principle component and multivariate analyses. The effect of chitin on ech30, ech42 and nag1 expression varied depending on the concentrations of glucose and ammonium acetate.
Forfattere
Tor Håkon SivertsenSammendrag
First the scientific method is graphically presented and interpreted in the following manner: `The test of a model is not considered merely as a test of the hypotheses, constructed mathematically, but it is also considered an explicit test of the definition of the quantitative parameters and the measuring systems of the input parameters as well". The representativeness of the input parameters to a specific model as well as the representativeness of the measured parameter values of the testing systems is considered crucial. The concept of representativeness of measured quantitative parameters is therefore outlined for further discussion and practical use in models. Furthermore the idea of differentiating the parameter definitions of the parameters of a model and the parameter definitions of a system for making measurements is presented. This notation is connected to the concept of `representativeness". The status of the system of equations of a model and the scope of such a system is discussed in the following manner: Prognostic system of equations is not interpreted as `governing" physical or biological phenomena, but `the definition of the quantitative parameters", `the system for making measurements" and the `equations" is considered a unit possible to test and use operationally. Thus the ideas of scale and representativeness are not considered separate from the system of equations.
Forfattere
Akiko Satake Ottar N. Bjørnstad Sverre KobroSammendrag
We analyzed berry production in rowan, Sorbus aucuparia L., in southern Norway and examined the ramifying effects of rowan masting on the dynamics of the dominant seed predator and its parasitoid. The apple fruit moth, Argyresthia conjugella Zeller, is a pre-dispersal seed predator of rowan. The larva of the apple fruit moth rely on rowan berries, which in turn is attacked by the parasitoid wasp, Microgaster politus Marsh. We found classic masting in rowan: berry production varied across years (the mean coefficient of variation = 1.02) and was spatially synchronized at large scale (the averaged correlation coefficient = 0.67). Berry production represented a two-year cycle in western but a three-year cycle in eastern Norway. The abundance of the moth and the parasitoid also varied across years and were spatially synchronized. The degree of spatial synchrony decreased and cyclicity became obscure with increasing trophic level. We attempted to assess two different components to the predator satiation, functional and numerical satiations, based on a simple population dynamics model. The observed pattern of seed predation testified that both of functional and numerical satiations were at work in this system. In a comparison at different locations, rowan trees with more variable berry production were more effective in reducing losses to the seed predator. The parasitoids also seemed to experience satiation through the fluctuation in their host abundance. These results show that rowan masting has an adaptive foundation, which impacts the dynamics of higher trophic levels.
Sammendrag
Anaerob behandling av våtorganisk avfall er på vei inn i norsk avfallsbehandling. Anaerob behandling har to sluttprodukter, metan og biorest. Bioresten inneholder organisk materiale og næringsstoffer og har derfor interesse som gjødselvare. Egenskapene til bioresten vil avhenge av råvarer som tilføres prosessen og av hvilke prosesstrinn den går gjennom under og etter anaerob behandling. Det er først og fremst tre produktformer det finnes erfaringer med. Flytende biorest er rik på lett tilgjengelige næringsstoffer og har potensial for bruk som hurtigvirkende gjødsel. Konsentrasjoner av næringsstoffer er høy og har relativt god balanse mellom hovednæringsstoffene. Det kan derfor være aktuelt med årlig gjødsling, uten at dette kommer i konflikt med mengdebegrensninger i gjødselvareforskriften. Flytende biorest tar i stor grad vare på næringsstoffene i avfallet og vil antakelig kunne benyttes som et alternativ til husdyrgjødsel der landbruket ikke har tilgang til dette. På den annen side krever det lagring og transport av store volumer, og både økonomi og avsetningsmuligheter i et slikt alternativ bør utredes videre. Gjennom videre foredling tapes mye av lett tilgjengelig nitrat og kalium. Avvannet og kompostert biorest vurderes derfor som jordforbedringsmidler med en viss gjødseleffekt. Kompostert biorest vil kunne benyttes som råvare i et dyrkingsmedium hvor den vil kunne fungere som en stabil og forutsigbar råvare. Kompostert biorest har et allsidig bruksområde og kan benyttes både av profesjonelle brukere og hobbydyrkere. Avvannet biorest kan først og fremst benyttes som jordforbedringsmidler med en viss gjødseleffekt til bruk på landbruket og grøntarealer. Enkelte avvannede biorester kan ha potensiale for bruk i dyrkingsmedier, om det er aktuelt bør man det gjøres en grundig vurdering av biorestens egenskaper i forkant.
Sammendrag
In coffee systems, shade management and pests control practices are related to the occurrence of arthropods and micro-organisms, because such practices alter the environmental conditions in the system. The insect pathogenic fungi Beauveria bassiana is used as a microbial control agent against coffee berry borer Hypothenemus hampei, in several countries in America, and it has also been reported to infect the coffee leaf miner Leucoptera coffeella. Only few studies have, however, focused on the natural infection level and the effect of shade and pest management on the dynamic of B. bassiana or other insect pathogenic fungi on key coffee pests. Understanding the dynamic of B. bassiana in the field and its genetic diversity is very important not only to favour its natural occurrence and enhance the natural control, but also to select strains with a good field performance and virulence. The main objectives of this PhD study conducted in Nicaragua are therefore to: a) determine the natural occurrence and infection level of B. bassiana on H. hampei and L. coffeella in unsprayed coffee plantations throughout two successive seasons; b) clarify whether B. bassiana is present as an endophyte in coffee trees, and determine whether B. bassiana injected into coffee plants can establish and persist; c) reveal the effect of shade and use of pesticides on insect pathogenic fungi on H. hampei and in the soil, and d) compare B. bassiana isolates obtained from L. coffeella, H. hampei and the soil at the same and different locations by the use of PCR techniques. The research is being carried out over a period of two years, 2004 and 2005. The natural occurrence and infection level of B. bassiana and the study on endophytic B. bassiana will be studied in unsprayed coffee plantations in the north and the pacific zone of Nicaragua. The experiment on the effect of shade and management practices will be carried out in plots with different pest management practices already established by CATIE in Masatepe, Nicaragua.
Sammendrag
Fylkesmannen i Hedmark er pilotfylke for å etablere en mer regionalisert tilskuddsordning for miljøtiltak i landbruket. Ordningen "Tilskudd til endret jordarbeiding" inngår her. Dette prosjektet har utredet en bedre profil på tildelingen som kan gi større miljøeffektivitet. Det er utarbeidet et forslag til en mer resipientorientert tildelingsprofil. I arbeidet er det brukt modellen GIS i avrenning som basert på søknadsinformasjon og NIJOS jordsmonnskart der det foreligger. Siden området som er med i undersøkelsen ikke har full dekning av jordsmonnskart ble det generert forenklede erosjonsrisikokart for de områdene som manglet. Det er utviklet et forslag til en resipientsårbarhetsindeks som tar hensyn til overvåkingsdata arealandelen landbruk i nedbørfeltet, andelen landbruk i kantsoner mot vassdrag og husdyrbelastning i nedbørfeltet. Med denne indeksen er det definert 57 soner i søndre Hedmark klassifisert i 3 klasser etter sårbarhet. Det er videre satt opp tre ulike profiler for hvordan tilskuddsmidler kan fordeles, og det er gjort kostnadseffektivitetsberegninger for disse. 1. Tilskudd til erosjonsrisikoklasse (Er) 1 og 2 faller bort for de mest robuste resipienter (Res 1). Er 1 faller bort for Res 2. Kostnadseffektiviteten bedres med 4,5% fra dagens ordning med dette scenariet. 2. Tilskudd som over, men alt tilskudd er Er 1 faller bort for Hedemarken kommunene. Kostnadseffektiviteten bedres med 6,3% fra dagens ordning med dette scenariet. 3. Forenkling av ER klasser slik at ER 3 og 4 slås sammen med dagens sats for Er 3, og Er 1 faller ut av tilskuddsordningen. Kostnadseffektiviteten bedres med 27,7% fra dagens ordning med dette scenariet. Det vil ved disse scenariene bli fristilt midler. Det anbefales at de fristilte tilskuddsmidler overføres til økt tilskudd til graskledde vannveier, vegetasjonssoner, fangdammer, og utbedring av hydrotekniske anlegg som forårsaker erosjon, da kostnadseffektiviteten ved disse tiltakene er høy.
Forfattere
T. Yli-Mattila R.L. Mach I.A. Alekhina S.A. Bulat S. Koskinen C.M. Kulling-Gradinger C.P. Kubicek Sonja KlemsdalSammendrag
Fusarium langsethiae was recently described to accommodate "powdery" isolates of Fusarium poae, which morphologically resemble F. poae, but whose metabolite profile is similar to that of Fusarium sporotrichioides. In order to investigate the phylogenetic relationship of F. langsethiae to closely related species, we sequenced the internal transcribed spacer (ITS) regions 1 and 2 and part of the intergenic spacer (IGS) region of the rDNA cluster and part of the ß-tubulin gene from 109 strains of F. poae, F. sporotrichioides, F. langsethiae and Fusarium kyushuense from different geographic origin. Sequence analysis of ITS1 and 2 was unable to separate all F. sporotrichioides strains from F. langsethiae strains. Sequence analysis of ß-tubulin distinguished all four species, but it did not resolve the phylogenetic relationship between these two species. Sequence analysis of the IGS region distinguished the four species and led to a higher number of subgroups of the individual species, of which that of F. sporotrichioides var. minus isolates was even better supported than that of F. poae and F. langsethiae. Neighbor-joining and POY analyses of all combined sequences reliably separated all species studied, including F. langsethiae, clearly from F. sporotrichioides. The high intraspecific variability of the IGS sequences were found useful to group isolates according to their geographic origin. These results are in accordance with the results of the UP-PCR hybridization analysis. In summary, our data offer molecular support for the description of F. langsethiae as a new species in section Sporotrichiella.
Sammendrag
Both insect pathogenic fungi and parasitoids are important for the regulation of insect pests in organic and integrated fruit production. In perennial crop systems, where the pest spends significant periods of time in permanent habitats, biological control is often successful. This is in part due to the stable and robust perennial ecosystem that acts as a reservoir for insect pathogens, parasitoids and other natural enemies of pests. Black cherry aphid (Myzus cerasi) is one of the most important pests on cherries all over the world. However, there are few studies on M. cerasi and insect pathogenic fungi. In this study the occurrence and importance of insect pathogenic fungi and parasitoids as natural enemies of the black cherry aphid was investigated throughout two successive seasons in Norway. Results show that in the first part of the season, from the last part of May to mid July, mostly parasitoids were found in dead aphids. Parasitoids of the following species were found: Ephedrus plagiator and E. persicae. The hyperparasitoids Alloxystra victrix and Dendrocerus sp. were also found in this part of the season, and a few individuals infected with fungi in the order Hyphomycetes (Verticillium lecanii). From the middle of July, fungi in the order Entomophthorales (Entomphthora planchoniana, Erynia neoaphidis and Conidiobolus obscurus) were found in dead aphids. Number of aphids killed by fungi increased towards the end of July. There was, however, a big variation in infection level between trees.
Sammendrag
The quantitative expression and the regulation of chitinase-encoding genes ech30, ech42 and nag1 in Trichoderma atroviride P1 under varying growth conditions were investigated using real-time RT-PCR, principle component and multivariate analyses. Twelve media combinations including 0.1 % and 3 % glucose as carbon source and no (0 mM), low (10mM) and high (100 mM) ammonium acetate as nitrogen source combined with or without colloidal chitin at 3 time intervals and 2 replications were applied to current study. The real-time RT-PCR analysis showed that the expression of ech30, ech42 and nag1 was regulated by the interaction of nitrogen, glucose and chitin under different growth conditions. The highest and earliest expressions of ech30 were induced by glucose and nitrogen starvation i.e. 0.1% glucose and 10 mM ammonium acetate in the growth media. This was also the case for ech42 and nag1 but at a relatively low level. In contrast, high (3%) glucose and high (100 mM) ammonium acetate concentrations repressed the expression of all the genes studied. These results were confirmed by principle component and multivariate analyses. The effect of chitin on ech30, ech42 and nag1 expression varied depending on the concentrations of glucose and ammonium acetate.