Publikasjoner
NIBIOs ansatte publiserer flere hundre vitenskapelige artikler og forskningsrapporter hvert år. Her finner du referanser og lenker til publikasjoner og andre forsknings- og formidlingsaktiviteter. Samlingen oppdateres løpende med både nytt og historisk materiale. For mer informasjon om NIBIOs publikasjoner, besøk NIBIOs bibliotek.
2004
Sammendrag
Pathogen colonization and transcript levels of three host chitinases,putatively representing classes I, II, and IV, were monitored with real-time PCR after wounding and bark infection by Heterobasidion annosum in 32-year-old trees of Norway spruce (Picea abies) with low (clone 409) or high (clone 589) resistance to this pathogen. Three days after inoculation, comparable colonization levels were observed in both clones in the area immediately adjacent to inoculation. At 14 days after infection, pathogen colonization was restricted to the area immediately adjacent to the site of inoculation for clone 589 but had progressed further into the host tissue in clone 409. Transcript levels of the class II and IV chitinases increased after wounding or inoculation, but the transcript level of the class I chitinase declined after these treatments. Transcript levels of the class II and class IV chitinases were higher in areas immediately adjacent to the inoculation site in clone 589 than in similar sites in clone 409 3 days after inoculation. This difference was even more pronounced 2 to 6 mm away from the inoculation point, where no infection was yet established, and suggests that the clones differ in the rate of chitinase-related signal perception or transduction. At 14 days after inoculation, these transcript levels were higher in clone 409 than in clone 589, suggesting that the massive upregulation of class II and IV chitinases after the establishment of infection comes too late to reduce or prevent pathogen colonization.
Sammendrag
We have monitored the H. annosum colonization rate and expression of host chitinases in Norway spruce material with differing resistances. Transcript levels of three chitinases, representing classes I, II and IV, were monitored with real-time PCR. Ramets of two 32 -year-old clones differing in resistance were employed as host material and inoculation and wounding was performed. Quantification of fungal colonization: Multiplex real-time PCR detection of host and pathogen DNA was performed. Chitinase transcript levels were also monitored with real-time PCR. Three days after inoculation, comparable colonization levels were observed in both clones in the area immediately adjacent to inoculation. Fourteen days after infection, pathogen colonization was restricted to the area immediately adjacent to the site of inoculation for the strong clone (589), but had progressed further into the host tissue in the weak clone (409). Transcript levels of the class II and IV chitinases increased following wounding or inoculation, while the transcript level of the class I chitinase declined following these treatments. Transcript levels of the class II and class IV chitinases were higher in areas immediately adjacent to the inoculation site in 589 than in similar sites in 409 three days after inoculation, suggesting that the clones differ in the rate of chitinase-related signal perception. The spatiotemporal accumulation patterns obtained for the two clones used are consistent with their resistance classifications, these warranting further and more detailed studies on these chitinases.
Forfattere
Amy M. Brunner Igor A. Yakovlev Steven H. StraussSammendrag
Background Real-time reverse transcription PCR (RT-PCR) has greatly improved the ease and sensitivity of quantitative gene expression studies. However, accurate measurement of gene expression with this method relies on the choice of a valid reference for data normalization. Studies rarely verify that gene expression levels for reference genes are adequately consistent among the samples used, nor compare alternative genes to assess which are most reliable for the experimental conditions analyzed. Results Using real-time RT-PCR to study the expression of 10 poplar (genus Populus) housekeeping genes, we demonstrate a simple method for determining the degree of stability of gene expression over a set of experimental conditions. Based on a traditional method for analyzing the stability of varieties in plant breeding, it defines measures of gene expression stability from analysis of variance (ANOVA) and linear regression. We found that the potential internal control genes differed widely in their expression stability over the different tissues, developmental stages and environmental conditions studied. ConclusionOur results support that quantitative comparisons of candidate reference genes are an important part of real-time RT-PCR studies that seek to precisely evaluate variation in gene expression. The method we demonstrated facilitates statistical and graphical evaluation of gene expression stability. Selection of the best reference gene for a given set of experimental conditions should enable detection of biologically significant changes in gene expression that are too small to be revealed by less precise methods, or when highly variable reference genes are unknowingly used in real-time RT-PCR experiments.
Forfattere
Bernt-Håvard ØyenSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Tove M. Østensvik Kaj Bo VeierstedSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Sammendrag
Sampling the catchment outlet generally is assumed to be a convenient way to infer information about a variety of biogeochemical processes at the catchment scale as it provides a spatial and temporal integral of the predominating catchment output fluxes for a number of chemical compounds of interest.Moreover, the short-term dynamics and long-term trends of the hydrograph and of solute concentrations in the catchment runoff can provide information about the predominating processes at the catchment scale and can be used to refine conceptual and mathematical models.Additional measurements inside the catchment, e.g., of soil solution, groundwater, and stream water at different sites, are used to relate the findings to within-catchment processes and thus to further constrain hypotheses and models.
Forfattere
Geir Isak Vestøl Olav Albert Høibø Sander Lilleslett Harald MyhreSammendrag
Bruk av rundtømmer og firkant av furu fra høyereliggende skog til bindingsverk og lafting har lange tradisjoner. Til lafting brukes det fortsatt mye rundtømmer, men i bindingsverk har det blitt mindre vanlig. I Nord-Gudbrandsdalen ønsker man å ta opp igjen tradisjonen med å bruke rundtømmer og firkant i bindingsverk, men det mangler dokumentasjon på egenskapene til slike materialer. Hensikten med dette arbeidet er å dokumentere de konstruktive egenskapene til rundtømmer og firkant av furu fra høyereliggende skog i regionen. Statisk bøyefasthet, elastisitetsmodul ved statisk bøying (E-modul) og basisdensitet ble testet på 94 prøver av rundtømmer med nominell dimensjon (toppdiameter) fra 100 mm til 225 mm. De samme egenskapene ble testet på 57 prøver av firkant skåret med tilnærmet 2/3 kant. Dimensjonene til firkant var fra 75 x 75 mm2 til 200 x 200 mm2. Rundtømmer ble tatt ut av 60 trær fra fire felt med høyereliggende furuskog i Lesja og Dovre, mens firkant ble tatt ut av 18 trær fra to av de samme feltene. Feltene ble valgt slik at de representerer variasjon i bonitet innenfor ulike høydelag. Gjennomsnittlig bøyefasthet til rundtømmer er 58,9 MPa og nedre 5 % fraktil er 40,0 MPa. Gjennomsnittlig E-modul er 12,1 GPa. Gjennomsnittlig basisdensitet er 382 kg/m3 og nedre 5 % fraktil er 333 kg/m3. Bøyefastheten øker med økende basisdensitet og E-modul, mens den avtar med økende årringbredde og dimensjon. Basisdensitet og E-modul er lavere for andrestokker enn for rotstokker, mens det ikke er funnet noen effekt av dimensjon på disse egenskapene. Gjennomsnittlig bøyefasthet til firkant skåret med 2/3 kant er 44,3 MPa, og nedre 5 % fraktil er 32,8 MPa. Gjennomsnittlig E-modul er 9,0 GPa. Gjennomsnittlig basisdensitet er 381 kg/m3 og nedre 5 % fraktil er 327 kg/m3. Bøyefasthet til firkant av rotstokkene er høyere enn firkant fra de øvrige stokkene. Verdiene for bøyefasthet og E-modul til rundtømmer av furu fra høyereliggende skog i Lesja og Dovre er høye. Særlig de laveste verdiene for bøyefasthet er høye sammenlignet med trelast. Dette medfører at dimensjonerende verdi for bøyefasthet til rundtømmer blir høy og at materialene derfor vil være godt egnet som konstruksjonsmaterialer. Rundtømmer kan styrkesorteres visuelt, men europeiske reglement som finnes er utviklet for tynningsvirke og undervurderer bøyefastheten til dette materialet. Styrkesortering basert på dimensjon, E-modul og basisdensitet vil gi mulighet for bedre nøyaktighet enn visuell sortering. Firkant med 2/3 kant har betydelig lavere bøyefasthet og E-modul enn rundtømmer, men verdiene for bøyefasthet er likevel relativt høye sammenlignet med skarpkantet trelast. Til formål hvor det er viktig med plane flater og hvor kravet til bøyefasthet og E-modul er mindre kan firkant være et godt alternativ.
Forfattere
Birger VenneslandSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag
Forfattere
Stig Lande Morten Eikenes Mats WestinSammendrag
Det er ikke registrert sammendrag