Støtteverktøy

Støtteverktøy hjelper modellører ved NIBIO med oppgaver som datainnsamling, databehandling, parameterisering og kalibrering av modeller, samt tolkning av resultater.

 

Miljotools

En stor del av arbeidsmengden for en "modellør" innen miljøvitenskap består av "arbeidsflyter". Disse arbeidsflytene dreier seg typisk om å hente inn data, konvertere data, og behandle data før de faktisk brukes i en modell. Selv etter bruk må data ofte etterbehandles før de gir meningsfull innsikt. Derfor benytter mange ansatte ved NIBIO seg av koding, skripting og automatiseringsverktøy.

Bruken av slike verktøy er imidlertid ofte begrenset til forfatteren eller en liten krets av nære kolleger, selv om de kunne vært nyttige for et bredt spekter av forskere ved NIBIO – eller til og med for det globale forskningsmiljøet. Miljotools har som mål å motvirke fragmenteringen av nyttige verktøy ved å tilby et felles arkiv med generaliserte og dokumenterte funksjoner, arbeidsflyter, skript osv. Disse tilbys i en åpen kildekode R-pakke kalt miljotools.

Du kan lese mer om prosjektet på GitHub:
https://moritzshore.github.io/miljotools/ 

Merk: Dette uoffisielle sideprosjektet er fortsatt i startfasen og inneholder foreløpig begrenset funksjonalitet. Hvis du ønsker å bidra, ta kontakt med vedlikeholderen for utvikleradgang og/eller hjelp til implementering.

 

 

 

1_Miljotools.jpg

 

rswap

rswap er en R-pakke utviklet for å hjelpe med grensesnitt og arbeid med SWAP4.2. Den består av en rekke funksjoner som hjelper brukeren med ellers tidkrevende og repeterende oppgaver under kalibreringsprosessen. I tillegg gir pakken mulighet for å kontrollere modellen og dens inputparametere direkte gjennom R-programmeringsmiljøet, noe som gjør det enkelt å implementere avanserte og automatiserte arbeidsflyter, samt koble modellen til de omfattende mulighetene i andre R-baserte forskningspakker.

Omfanget av pakken vil forhåpentligvis utvides over tid til å inkludere sensitivitetstester, parallellisering med flere kjerner, automatisk kalibrering / PEST-integrasjon, scenariokjøringer og mye mer.

Du kan lese mer om denne pakken på GitHub:

https://github.com/moritzshore/rswap

 

 

 

2_RSWAP.jpg